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Oligo
7.56 官方版
- 软件大小:15.9MB
- 更新日期:2022-02-15
- 下载次数:0次
- 软件语言:简体
- 软件授权:共享软件
- 软件评级:
- 安全检测:无插件无病毒
- 软件类型:国外软件
- 软件分类:应用程序
- 软件系统:Mac OS 9
Oligo简介
Oligo官方版是款设计行业中经常使用到饿引物设计软件。Oligo正式版主要用于核酸序列引物分析设计,可同时计算核酸序列的杂交温度(Tm)和理论预测序列二级结构。并且Oligo还具备基于最近邻热力学数据,低聚糖的搜索算法寻找最佳引物PCR,包括TaqMan、高度多路复用,共识或简并引物。
{mac2}
Oligo软件功能
1、分析TM和内部稳定性,绘制溶解温度图和稳定性图
2、给出寡核苷酸的重要相关信息
3、显示正向引物、反向引物和当前的OLIGO里潜在的连接物,潜在的二聚物也可显示出来
4、分析显示在选中的正向引物或反向引物中基本的成份和溶解温度
5、精确地分析出生物信息软件中的错配位点
6、正向引物和反向引物选中后,能自动产生PCR实验条件和PCR产物信息
Oligo软件特色
软件的体积方面还是比较的小巧
而且使用也简单,直观的用户界面
可以让用户更加轻松的完成对软件的操作
也可将本地里面的文件进行添加到软件里面进行试验
还可将功能进行快速的操作设置
Oligo使用方法
1、打开oligo,分别单击File——New Sequence,在打开的窗口中输入DNA序列,然后单击序列上面的勾就OK了。
2、单击菜单栏的Search——for Primers & Probes...
3、分别单击 Parameters 和 Ranges 设计引物的参数和范围。接下来先单击 Parameters。只需修改引物长度和Tm值的范围即可,如下方第一张图。另外因为突变位点是确定的,所以要确定下游引物的位置,如下方第二张图所示,即固定了3'端的位置(这里笔者是将突变位点处的引物作为下游引物)
4、再单击Ranges,设计范围如下图。一般PCR产物长度250——500bp为宜。注:该突变位点在20258bp的位置。
5、单击Search,如下方第一张图。跳出搜索结果,如下方第二张图。
6、双击上方第二张图中搜索到的引物,跳出的窗口如下图,是该对引物的基本信息,包括上下游的位置,长度,Tm值,GC含量,分数等。
7、单击菜单栏Edit——Reverse Primer,打开下方第一张图的界面,将3’端第三或第四位的碱基改成错配(这里是将第四位的碱基G改为A,因为这样改可以取消下游引物的发夹结构),改好后如下方第二张图。并单击第二张图菜单栏下方的勾。
Oligo更新日志
1. 优化的脚步从未停止!
2. 更多小惊喜等你来发现~
51下载小编推荐:
在经历了多次的更新与优化,Oligo变得更加的人性化,也更加的简单易操作,{zhandian}小编亲测,推荐给大家下载,感兴趣的小伙伴还可以下载{recommendWords}。
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